- ATGC BioInformatique

La plateforme ATGC, labellisée par IBiSA en 2010, est soutenue par des Projets d'Investissement d'Avenir : l'IFB (Institut Français de Bioinformatique), France Génomique et le Labex NUMEV. La plateforme est adossée à l’équipe de recherche MAB (Méthodes et Algorithmes pour la Bioinformatique) et bénéficie également des recherches réalisées au sein de l'IBC (Institut de Biologie Computationelle).

La plateforme a la triple vocation de diffuser les outils bioinformatiques développés au sein de la communauté montpelliéraine, de favoriser les collaborations entre partenaires informaticiens et biologistes, et d’apporter une aide à ces chercheurs en mettant en place des services bioinformatiques en lien direct avec leurs travaux.

Logiciels

Les outils sont accessibles en ligne gratuitement. Ils peuvent être téléchargés et/ou exécutés sur les clusters du LIRMM. Les outils distribués sur ATGC ont une très grande visibilité internationale, le logiciel PhyML (développé au sein de l’équipe MAB, et classé « Current Classic » depuis Octobre 2007 par Science Watch) a été cité plus de 15 000 fois (cf. Web of Science).

Responsables

Responsable technique: Vincent LEFORT

Responsables scientifiques: Stéphane GUINDON et Eric RIVALS

La plateforme Bioinformatique est administrée par le service Réseaux du LIRMM.

Formations ATGC 2020

Bioinformatique pour le traitement de données de séquençage (NGS) lundi 23/03/2020 au vendredi 27/03/2020 https://cnrsformation.cnrs.fr/stage-20024-Bioinformatique-pour-le-traitement-de-donnees-de-sequencage-%28NGS%29.html?axe=114
Phylogénie moléculaire - formation de base mardi 31/03/2020 au jeudi 02/04/2020 https://cnrsformation.cnrs.fr/stage-20021-Phylogenie-moleculaire---formation-de-base.html?axe=114
Bioinformatique pour la métagénomique mercredi 03/06/2020 au vendredi 05/06/2020 https://cnrsformation.cnrs.fr/stage-20324-Bioinformatique-pour-la-metagenomique.html?stage=20324&axe=114
Phylogénie moléculaire - formation avancée mardi 06/10/2020 au jeudi 08/10/2020 https://cnrsformation.cnrs.fr/stage-20287-Phylogenie-moleculaire---formation-avancee.html?axe=114
Scripts en Python pour la bioinformatique et environnement Linux mercredi 04/11/2020 au vendredi 06/11/2020 https://cnrsformation.cnrs.fr/stage-20027-Scripts-en-Python-pour-la-bioinformatique-et-environnement-Linux.html?axe=114

Dernière mise à jour le 13/01/2020